Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms