Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms