Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms