Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF2Q9HAU5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms