Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD1Q9H446 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD1Q9H446 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms