Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGNBP2Q9H3C7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGNBP2Q9H3C7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms