Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN1Q9GZU1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms