Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTR3CQ9C0K3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms