Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms