Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms