Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms