Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms