Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms