Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms