Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms