Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms