Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms