Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms