Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TM2D3Q9BRN9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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