Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms