Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms