Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBF4Q9BQW3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms