Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF3RQ99062 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF3RQ99062 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF3RQ99062 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF3RQ99062 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF3RQ99062 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF3RQ99062 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms