Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms