Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms