Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC38A2Q96QD8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms