Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms