Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms