Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms