Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms