Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms