Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms