Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EP400Q96L91 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms