Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC35A4Q96G79 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms