Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BICD1Q96G01 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms