Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms