Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms