Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms