Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms