Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms