Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3RF3Q8TEJ3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms