Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf43Q8TAL5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms