Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEA6

GLIS3, Zinc finger protein GLIS3, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3Q8NEA6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GLIS3Q8NEA6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms