Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms