Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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DTX3Q8N9I9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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DTX3Q8N9I9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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DTX3Q8N9I9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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DTX3Q8N9I9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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DTX3Q8N9I9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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DTX3Q8N9I9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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