Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms