Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms