Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF554Q86TJ5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms