Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms