Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms